33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2223 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  84.4 
 
 		 165 aa  252  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  75.16 
 
 		 153 aa  246  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  69.28 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  66 
 
 		 154 aa  205  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  44.97 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  40.67 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  42.28 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  39.33 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  40.26 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  38.67 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  37.33 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  37.33 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  37.33 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  37.58 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  39.07 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  39.46 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  37.33 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  38 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  38.67 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  38.67 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  35.81 
 
 		 185 aa  98.2  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  34.87 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  37.25 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  42.64 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  30.07 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  37.41 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  29.05 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  28.93 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.62 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  30.28 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>