147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1723 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  100 
 
 		 152 aa  308  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  55.26 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  54.3 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  55.19 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  53.64 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  52.32 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  50.33 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  50.98 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  49.02 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  49.67 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  49.04 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  45.7 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.28 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  43.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  43.84 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  45.21 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  42.07 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  39.33 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  39.1 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  40.44 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  40.69 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  38.93 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  35.37 
 
 		 185 aa  101  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  38.36 
 
 		 198 aa  100  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.25 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  42.97 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  36.36 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  32.68 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  33.33 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  33.8 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  31.75 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  27.74 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  30.95 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  28.93 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  30.23 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  30.5 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  29.29 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  28.68 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  27.54 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  27.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  28.28 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  32.35 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  35.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  36.99 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  30.14 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  35.82 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  32.39 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  27.91 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  28.99 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  30.99 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  26.28 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  26.28 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  31.37 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>