More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0271 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  100 
 
 		 113 aa  223  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  59.18 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0414  50S ribosomal protein L22  58.16 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.249175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  46.15 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  44.23 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  47.12 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  44.23 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0676  50S ribosomal protein L22  46.46 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0432957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  44.9 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3790  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  44.23 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  48.51 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  44.23 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  47.52 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  47.52 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  44 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  43.14 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0261  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  45.45 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0208  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.813634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  45.1 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  44 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  42.31 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  40.38 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  45.26 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  40.95 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  40.78 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0332  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268169  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2627  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00739317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2835  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000576673  normal  0.189741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3741  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000060357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3771  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3452  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000048605  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0254  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00176884  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3483  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3063  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000747087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3799  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3164  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000561791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3312  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000860749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1929  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000352349  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2754  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000226308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0281  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617614  normal  0.0696934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0272  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00175067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0353  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000911683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  41.51 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  44.9 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  41.51 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  43.69 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>