75 genes were found for organism Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Shew185_4383  CDS  NC_009661  14  385  +  372  hypothetical protein  YP_001355405  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4384  CDS  NC_009661  397  1371  +  975  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_001355406  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4385  CDS  NC_009661  2214  2942  +  729  hypothetical protein  YP_001355407  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4386  CDS  NC_009661  3187  3816  -  630  resolvase domain-containing protein  YP_001355408  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4387  CDS  NC_009661  4059  4328  +  270  hypothetical protein  YP_001355409  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4388    NC_009661  4480  4836  +  357      normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4389  CDS  NC_009661  5103  5477  -  375  hypothetical protein  YP_001355410  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4390  CDS  NC_009661  5474  6043  -  570  chromosome partitioning ATPase-like protein  YP_001355411  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4391  CDS  NC_009661  6732  7304  -  573  hypothetical protein  YP_001355412  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4392  CDS  NC_009661  7426  8585  +  1160  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001355413  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4393  CDS  NC_009661  8558  10060  -  1503  hypothetical protein  YP_001355414  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4394  CDS  NC_009661  10735  11355  +  621  hypothetical protein  YP_001355415  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4395  CDS  NC_009661  11448  11720  +  273  hypothetical protein  YP_001355416  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4396  CDS  NC_009661  12047  12289  +  243  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  YP_001355417  normal  1  normal  0.921307  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4397  CDS  NC_009661  12279  12563  +  285  addiction module antitoxin  YP_001355418  normal  1  normal  0.935834  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4398  CDS  NC_009661  12762  13685  +  924  transposase IS4 family protein  YP_001355419  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4399  CDS  NC_009661  13889  14917  +  1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001355420  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4400  CDS  NC_009661  15141  16318  -  1178  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001355421  normal  1  normal  0.55958  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4401  CDS  NC_009661  16377  17416  -  1040  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001355422  normal  1  normal  0.518435  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4402    NC_009661  17479  17715  +  237      normal  1  normal  0.412208  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4403  CDS  NC_009661  17989  18861  +  873  integrase catalytic region  YP_001355423  normal  0.291607  normal  0.47214  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4404  CDS  NC_009661  18998  20953  +  1956  hypothetical protein  YP_001355424  hitchhiker  0.000617374  normal  0.241349  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4405    NC_009661  21095  21669  +  575      hitchhiker  0.0000306701  normal  0.327024  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4406  CDS  NC_009661  21807  22499  +  693  integrase catalytic region  YP_001355425  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4407  CDS  NC_009661  22661  23524  +  864  hypothetical protein  YP_001355426  hitchhiker  0.000000325165  normal  0.0739  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4408  CDS  NC_009661  23758  24366  +  609  resolvase domain-containing protein  YP_001355427  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4409  CDS  NC_009661  24427  24732  +  306  hypothetical protein  YP_001355428  hitchhiker  0.00549026  normal  0.0645372  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4410  CDS  NC_009661  25485  26087  +  603  hypothetical protein  YP_001355429  normal  0.358993  normal  0.0710629  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4411  CDS  NC_009661  26459  26947  +  489  hypothetical protein  YP_001355430  normal  0.203686  normal  0.0676205  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4412    NC_009661  27539  29211  +  1673      hitchhiker  0.000157405  normal  0.0192173  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4413  CDS  NC_009661  27821  28980  +  1160  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001355431  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4414  CDS  NC_009661  29199  30455  +  1257  DNA-repair protein  YP_001355432  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4415  CDS  NC_009661  30975  31706  +  732  deoxyribonuclease I  YP_001355433  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4416  CDS  NC_009661  31721  31954  +  234  hypothetical protein  YP_001355434  hitchhiker  1.88926e-20  decreased coverage  0.00155815  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4417  CDS  NC_009661  32345  34225  +  1881  nuclease  YP_001355435  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4418  CDS  NC_009661  34350  34805  +  456  hypothetical protein  YP_001355436  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4419  CDS  NC_009661  34807  35295  +  489  hypothetical protein  YP_001355437  hitchhiker  0.0000000152336  normal  0.014532  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4420  CDS  NC_009661  35326  35547  +  222  hypothetical protein  YP_001355438  hitchhiker  0.0000000792828  normal  0.0663104  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4421  CDS  NC_009661  35917  36846  +  930  hypothetical protein  YP_001355439  hitchhiker  0.0000987997  normal  0.121294  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4422  CDS  NC_009661  36848  37249  +  402  hypothetical protein  YP_001355440  hitchhiker  0.000643552  normal  0.0637784  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4423  CDS  NC_009661  37619  37912  +  294  hypothetical protein  YP_001355441  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4424  CDS  NC_009661  37893  38402  +  510  hypothetical protein  YP_001355442  hitchhiker  0.0000808902  normal  0.0637784  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4425  CDS  NC_009661  38515  38742  +  228  HicB-related protein  YP_001355443  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4426  CDS  NC_009661  39317  40315  +  999  hypothetical protein  YP_001355444  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4427  CDS  NC_009661  40364  40663  +  300  hypothetical protein  YP_001355445  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4428  CDS  NC_009661  41221  41580  +  360  hypothetical protein  YP_001355446  normal  1  normal  0.523095  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4429  CDS  NC_009661  41601  47561  -  5961  conjugative transfer relaxase protein TraI  YP_001355447  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4430  CDS  NC_009661  47813  49939  -  2127  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_001355448  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4431  CDS  NC_009661  49942  50475  -  534  hypothetical protein  YP_001355449  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4432  CDS  NC_009661  50513  53323  -  2811  TraG domain-containing protein  YP_001355450  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4433  CDS  NC_009661  53326  54714  -  1389  TraH family protein  YP_001355451  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4434  CDS  NC_009661  54897  55340  -  444  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  YP_001355452  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4435  CDS  NC_009661  55337  56074  -  738  hypothetical protein  YP_001355453  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4436  CDS  NC_009661  56110  56985  -  876  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  YP_001355454  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4437  CDS  NC_009661  56982  58796  -  1815  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_001355455  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4438  CDS  NC_009661  58793  59530  -  738  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  YP_001355456  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4439  CDS  NC_009661  59553  60566  -  1014  TraU family protein  YP_001355457  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4440  CDS  NC_009661  60553  61257  -  705  Type-F conjugative transfer system protein TraW  YP_001355458  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4441  CDS  NC_009661  61254  61625  -  372  pilus assembly protein  YP_001355459  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4442  CDS  NC_009661  61627  64215  -  2589  Type-IV secretion system protein TraC  YP_001355460  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4443  CDS  NC_009661  64219  64662  -  444  Type IV conjugative transfer system protein TraV  YP_001355461  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4444  CDS  NC_009661  64695  66221  -  1527  TraB pilus assembly family protein  YP_001355462  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4445  CDS  NC_009661  66218  67036  -  819  Type-F conjugative transfer system secretin TraK  YP_001355463  normal  0.620331  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4446  CDS  NC_009661  67036  67602  -  567  TraE family protein  YP_001355464  normal  0.622638  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4447  CDS  NC_009661  67643  67945  -  303  Type IV conjugative transfer system protein TraL  YP_001355465  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4448  CDS  NC_009661  67949  68320  -  372  hypothetical protein  YP_001355466  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4449  CDS  NC_009661  69924  70655  +  732  hypothetical protein  YP_001355467  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4450  CDS  NC_009661  71317  71547  -  231  hypothetical protein  YP_001355468  normal  0.906152  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4451  CDS  NC_009661  71713  72912  +  1200  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001355469  normal  0.375885  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4452  CDS  NC_009661  72912  74009  +  1098  ParB family protein  YP_001355470  normal  0.0140271  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4453  CDS  NC_009661  74373  75074  +  702  FRG domain-containing protein  YP_001355471  hitchhiker  0.00112115  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4454  CDS  NC_009661  75500  77527  +  2028  N-6 DNA methylase  YP_001355472  normal  0.0195788  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4455  CDS  NC_009661  77524  78690  +  1167  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_001355473  normal  0.353509  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4456  CDS  NC_009661  78687  81926  +  3240  type III restriction protein res subunit  YP_001355474  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_4457  CDS  NC_009661  81931  83199  +  1269  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_001355475  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>