11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4441 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4441  pilus assembly protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4437  conjugal transfer protein TrbI  98.37 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.391432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4534  pilus assembly protein  98.37 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.783095 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4379  conjugal transfer protein TrbI  98.37 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4626  hypothetical protein  98.11 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.893859 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4503  conjugal transfer protein TrbI  91.06 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0028  conjugal transfer protein TrbI  31.13 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_09  conjugative transfer protein TrbI  30.11 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0021  hypothetical protein  25.84 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4228  sex-pilus assembly protein  31.58 
 
 		 119 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4291  hypothetical protein  32.47 
 
 		 138 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>