More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4390 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009036  Sbal_4415  chromosome partitioning ATPase-like protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4640  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.878037 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4486  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905908  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4390  chromosome partitioning ATPase-like protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  28.11 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.36 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.6 
 
 
231 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.36 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.6 
 
 
231 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
220 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
220 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
220 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.19 
 
 
231 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.19 
 
 
231 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 
232 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.15 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  30.65 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.05 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.57 
 
 
255 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 
207 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  29.36 
 
 
220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  36.11 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  34.23 
 
 
209 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.47 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
217 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
261 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  52.27 
 
 
270 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  54.17 
 
 
365 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.11 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  46.43 
 
 
460 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  34.65 
 
 
261 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  55.81 
 
 
253 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.39 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.11 
 
 
270 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.39 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.27 
 
 
265 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 
262 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.27 
 
 
452 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.53 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  47.73 
 
 
305 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.27 
 
 
312 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
410 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.1 
 
 
260 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  54.55 
 
 
330 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.45 
 
 
263 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.59 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.55 
 
 
274 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  23.85 
 
 
222 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  26.74 
 
 
206 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
217 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  47.17 
 
 
268 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  54.76 
 
 
279 aa  51.6  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
293 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.89 
 
 
315 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.94 
 
 
263 aa  51.6  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.94 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.94 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 
335 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.35 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 
333 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.5 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 
335 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>