151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4405 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  99.11 
 
 
1178 bp  1072    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4335    98.75 
 
 
1178 bp  1057    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4340    100 
 
 
560 bp  1110    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000345949  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  98.75 
 
 
1178 bp  1057    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4405    100 
 
 
575 bp  1140    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000306701  normal  0.327024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  98.75 
 
 
1178 bp  1057    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
312 bp  618  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 
312 bp  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 
312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 
312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  99.04 
 
 
312 bp  595  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  98.72 
 
 
312 bp  587  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  97.74 
 
 
312 bp  559  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  97.74 
 
 
312 bp  559  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  94.52 
 
 
312 bp  480  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 
813 bp  375  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  99.48 
 
 
813 bp  371  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  99.48 
 
 
813 bp  371  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  98.45 
 
 
813 bp  359  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  97.93 
 
 
612 bp  351  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  95.34 
 
 
813 bp  311  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  95.34 
 
 
813 bp  311  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  94.82 
 
 
813 bp  303  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4659  integrase, catalytic region  100 
 
 
132 bp  262  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.63226  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  83.96 
 
 
312 bp  75.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  92.31 
 
 
303 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  92 
 
 
369 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4856  IS911, transposase orfA  92 
 
 
303 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 
300 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 
300 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 
300 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000267375  decreased coverage  0.000000000178046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  100 
 
 
309 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 
306 bp  60  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2980    97.06 
 
 
523 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0192958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 
303 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>