49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4453 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  39.22 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  36.07 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  32.53 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  35.03 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  34.52 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  34.52 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  34.52 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  30.91 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  33.5 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  33.5 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  31.58 
 
 		 264 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  31.16 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  30.96 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  30.7 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  30.48 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  30.48 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  30.48 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  27.73 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  27.96 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  27.73 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  26.01 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  26.38 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  28.51 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  26.17 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  25.18 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  23.79 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  41.49 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  36.26 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  24.02 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  34.58 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  34.21 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  43.37 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  30.84 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  62.5 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  38.95 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0061  FRG domain protein  31.31 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2466  hypothetical protein  24.7 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.433684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  28.57 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  30.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  22.93 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  26 
 
 		 384 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  37.66 
 
 		 300 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2999  hypothetical protein  30.34 
 
 		 90 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  32.74 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  30.56 
 
 		 427 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  34.44 
 
 		 456 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  23.25 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>