44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2167 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  51.92 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  48 
 
 		 427 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  43.88 
 
 		 433 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  43.69 
 
 		 300 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  40.43 
 
 		 456 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  52.17 
 
 		 519 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  41.11 
 
 		 342 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  41.67 
 
 		 297 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  51.85 
 
 		 380 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  36.17 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  47.76 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  40.86 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  43.24 
 
 		 318 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  58 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  56.25 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  38.75 
 
 		 308 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  36.11 
 
 		 261 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  36 
 
 		 243 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  60.61 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  60.61 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  40.98 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  32.74 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  44.9 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  41.54 
 
 		 265 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  38.81 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  53.85 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  38.75 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  38.18 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05340  FRG domain protein  36.84 
 
 		 311 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  42.25 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  35.29 
 
 		 384 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  58.06 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  31.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  31.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  52.63 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  31.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  33.77 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  34.72 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  33.77 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  33.77 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>