48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3768 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  100 
 
 		 264 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  98.11 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  34.03 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  31.58 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  35.32 
 
 		 209 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  30 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  27.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  31.2 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  30.13 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  29.73 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  31.3 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  32.02 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  29.22 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  27.17 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  31.28 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  30.05 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  27.07 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  27.94 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  27.07 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  27.43 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  27.07 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  28.51 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  29.15 
 
 		 519 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  54.39 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  31.18 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  28.95 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  29.71 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  26.74 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  25.37 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  23.77 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  39.25 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  36.27 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  55.56 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  24 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  37.23 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  32.43 
 
 		 456 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  60.61 
 
 		 111 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  29.6 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  26.98 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0061  FRG domain protein  46.15 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  67.86 
 
 		 433 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 573 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  62.96 
 
 		 384 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>