45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5513 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  80.57 
 
 
246 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  82.43 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  82.43 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  81.59 
 
 
246 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  78.95 
 
 
246 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  45.34 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  44.05 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  44.05 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  44.05 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  36.1 
 
 
277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  32.86 
 
 
243 aa  118  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  34.52 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  28.62 
 
 
308 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  29.09 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  27.51 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  26.92 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  27.17 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  28.45 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  29.59 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  26.72 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  26.45 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  29.67 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  29.92 
 
 
380 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  23.31 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  24.02 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  25.5 
 
 
301 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  28.77 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  25.29 
 
 
342 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  27.9 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  26.17 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  27.69 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  27.13 
 
 
519 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  39 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  33.66 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  23.79 
 
 
427 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  23.84 
 
 
433 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  26.35 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  36.54 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  26.18 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  23.74 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>