46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1407 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  36.1 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  35.61 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  35.61 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  36.1 
 
 
246 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  35.12 
 
 
246 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  36.1 
 
 
246 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  33.2 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  30.74 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  36.74 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  30.96 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  32.06 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  32.86 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  31.6 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  31.2 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  36.49 
 
 
224 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  26.6 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  27.88 
 
 
384 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  27.1 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  39 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  37.5 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  31.47 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  37.62 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  28.42 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  28.17 
 
 
519 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  33.98 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  28.99 
 
 
280 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  36 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  26.82 
 
 
381 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  36.36 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  32.48 
 
 
433 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  25.98 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  33.85 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  31.2 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  36.67 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  45.83 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  26.95 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  38.24 
 
 
165 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2466  hypothetical protein  25.9 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.433684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  28.8 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  38.18 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  37.96 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  28.92 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>