45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6563 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  97.56 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  82.52 
 
 		 246 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  82.11 
 
 		 246 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  82.11 
 
 		 246 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  80.57 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  45.83 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  45.5 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  45.5 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  45.5 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  36.1 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  32.2 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  33.5 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  28.63 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  27.48 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  30.46 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  27.43 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  27.43 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  28.43 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  34.48 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  29.51 
 
 		 342 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  37.3 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  38.38 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  32.56 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  22.87 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  26.25 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  30.72 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  38.6 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  25.35 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  28.95 
 
 		 519 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  24.55 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  29.75 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  30.17 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  21.37 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  33.67 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  33.63 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  23.77 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  24.36 
 
 		 456 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  23.48 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  33.9 
 
 		 427 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  24.32 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  32.35 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0169  FRG domain protein  30.93 
 
 		 338 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>