36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6907 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  30.22 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  28.83 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  37.1 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  28.12 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  27.56 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  27.01 
 
 
384 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  26.88 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  27.69 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  32.81 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  28.4 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  38.04 
 
 
270 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  38.04 
 
 
270 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  38.04 
 
 
270 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  24.72 
 
 
266 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  38.95 
 
 
233 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  27.46 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  35.85 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0061  FRG domain protein  31.2 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  25.7 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  25.87 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  25.87 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  25.48 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  32.28 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  24.32 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  30.53 
 
 
519 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  23.94 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  23.79 
 
 
456 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  39.76 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  25.47 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  29.75 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05340  FRG domain protein  28.1 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  29.5 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  30.48 
 
 
165 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  31.43 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  33.7 
 
 
119 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>