40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2223 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  795    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  26.7 
 
 		 243 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  29.06 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  27.88 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0061  FRG domain protein  26.54 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2466  hypothetical protein  32.33 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.433684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  30.53 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  27.8 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  27.01 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  26.17 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  25.7 
 
 		 246 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  31.14 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  25.35 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  29.22 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  35.85 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  24.36 
 
 		 275 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6542  hypothetical protein  25.23 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1289  hypothetical protein  25.23 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6149  FRG domain-containing protein  25 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  24.28 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  29.28 
 
 		 228 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  26 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  29.27 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  30.39 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  32.32 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  44.64 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  31.07 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  46.15 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  24.34 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  36.84 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  40 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  47.5 
 
 		 229 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  20.28 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>