More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4414 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  100 
 
 		 418 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  100 
 
 		 418 aa  872    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  100 
 
 		 418 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  64.03 
 
 		 418 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  62.11 
 
 		 418 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  61.63 
 
 		 418 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  61.39 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  60.67 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  60.43 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  60.67 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  62.83 
 
 		 418 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  59.71 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  59.47 
 
 		 418 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  62.11 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  62.11 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  57.79 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  58.61 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  55.88 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  55.5 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2120  DNA-repair protein  61.54 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  50.36 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  50.84 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  48.46 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  44.36 
 
 		 416 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  42.55 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2284  DNA-directed DNA polymerase  59.22 
 
 		 256 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.456765  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  41.55 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  41.61 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  42.25 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  42.08 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 424 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 424 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  40.19 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  41.37 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  40.8 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  40.94 
 
 		 424 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 423 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  38.68 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  40.05 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  37.73 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  37.05 
 
 		 425 aa  295  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  36.82 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  39.34 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  38 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  38.59 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 426 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  37.91 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.34 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 		 430 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4349  umuC protein  60.45 
 
 		 221 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.844535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  37.09 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0172  DNA-repair protein  63.16 
 
 		 218 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  39.62 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  36.93 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  40.19 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  36.41 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  39.34 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  37.62 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  39.11 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  39.25 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  35.62 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 423 aa  265  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  33.96 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  36.12 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  37.27 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  34.98 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.02 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  37.24 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  35.15 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 423 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  34.76 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  35.8 
 
 		 478 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  34.71 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 		 437 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  34.31 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  35.28 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  32.78 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>