72 genes were found for organism Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VSAL_p840_01  CDS  NC_011311  111  281  +  171  conjugative transfer protein TraY  YP_002261491  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_02  CDS  NC_011311  423  704  +  282  conjugative transfer protein TraA, putative fimbrial protein precursor  YP_002261492  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_03  CDS  NC_011311  733  1035  +  303  conjugative transfer protein TraL  YP_002261493  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_04  CDS  NC_011311  1035  1595  +  561  conjugative transfer protein TraE  YP_002261494  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_05  CDS  NC_011311  1592  2347  +  756  conjugative transfer protein TraK  YP_002261495  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_06  CDS  NC_011311  2337  3767  +  1431  conjugative transfer protein TraB  YP_002261496  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_07  CDS  NC_011311  3780  4181  +  402  putative lipoprotein, putative TraV protein  YP_002261497  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_08  CDS  NC_011311  4191  6722  +  2532  conjugative transfer protein TraC  YP_002261498  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_09  CDS  NC_011311  6719  7066  +  348  conjugative transfer protein TrbI  YP_002261499  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_10  CDS  NC_011311  7063  7719  +  657  conjugative transfer protein TraW  YP_002261500  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_11  CDS  NC_011311  7732  8736  +  1005  conjugative transfer protein TraU  YP_002261501  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_12  CDS  NC_011311  9050  9817  +  768  hypothetical protein, putative conjugative transfer protein TrbC  YP_002261502  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_13  CDS  NC_011311  9821  11539  +  1719  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_002261503  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_14  CDS  NC_011311  11549  12292  +  744  conjugative transfer protein TraF  YP_002261504  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_15  CDS  NC_011311  12282  13049  +  768  membrane protein  YP_002261505  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_16  CDS  NC_011311  13119  13544  +  426  conjugative transfer protein TrbB  YP_002261506  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_17  CDS  NC_011311  13541  14926  +  1386  conjugative transfer protein TraH  YP_002261507  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_18  CDS  NC_011311  14923  17718  +  2796  conjugative transfer protein TraG  YP_002261508  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_19  CDS  NC_011311  17817  18314  +  498  hypothetical protein  YP_002261509  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_20  CDS  NC_011311  18326  20404  +  2079  conjugative transfer protein TraD  YP_002261510  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_21  CDS  NC_011311  20545  26355  +  5811  protein TraI (DNA helicase I)  YP_002261511  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_22  CDS  NC_011311  26399  26752  -  354  hypothetical protein  YP_002261512  normal  0.851215  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_23  CDS  NC_011311  27390  27827  -  438  transglycosylase PilT  YP_002261513  normal  0.846222  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_24  CDS  NC_011311  27861  28256  -  396  hypothetical protein  YP_002261514  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_25  CDS  NC_011311  28293  29294  -  1002  antirestriction protein ArdC  YP_002261515  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_26  CDS  NC_011311  30133  30489  -  357  hypothetical protein  YP_002261516  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_27  CDS  NC_011311  30649  31068  -  420  hypothetical protein  YP_002261517  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_28  CDS  NC_011311  31361  31636  +  276  DNA-binding protein HU-alpha  YP_002261518  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_29  CDS  NC_011311  31792  32052  -  261  hypothetical protein  YP_002261519  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_30  CDS  NC_011311  32178  32468  -  291  hypothetical protein  YP_002261520  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_31  CDS  NC_011311  32491  32940  -  450  hypothetical protein  YP_002261521  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_32  CDS  NC_011311  32930  33313  -  384  hypothetical protein  YP_002261522  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_33  CDS  NC_011311  33384  33848  -  465  DNA repair protein RadC  YP_002261523  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_34  CDS  NC_011311  33897  34496  -  600  hypothetical protein  YP_002261524  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_35  CDS  NC_011311  35695  36213  +  519  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  YP_002261525  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_36  CDS  NC_011311  36284  38548  +  2265  VgrG protein, VgrG-2  YP_002261526  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_37  CDS  NC_011311  38530  39123  +  594  hypothetical protein  YP_002261527  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_38  CDS  NC_011311  39139  41583  +  2445  putative cell wall degradation protein  YP_002261528  normal  0.145908  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_39  CDS  NC_011311  41661  42728  -  1068  putative lipoprotein  YP_002261529  normal  0.0742904  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_40  CDS  NC_011311  43036  44232  +  1197  putative plasmid partition protein A  YP_002261530  normal  0.0786785  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_41  CDS  NC_011311  44232  45239  +  1008  putative plasmid partition protein B  YP_002261531  normal  0.0344008  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_42  CDS  NC_011311  45731  46276  -  546  putative resolvase  YP_002261532  normal  0.0684051  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_43  CDS  NC_011311  46692  46922  -  231  hypothetical protein  YP_002261533  normal  0.0307665  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_44  CDS  NC_011311  46932  47567  -  636  putative resolvase  YP_002261534  normal  0.0377389  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_45  CDS  NC_011311  47865  49046  -  1182  transposase  YP_002261535  normal  0.0298487  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_46  CDS  NC_011311  49322  51541  +  2220  putative cell wall degradation protein  YP_002261536  normal  0.0169743  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_47  CDS  NC_011311  51541  51930  +  390  hypothetical protein  YP_002261537  hitchhiker  0.00780492  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_48  CDS  NC_011311  52192  52560  -  369  hypothetical protein  YP_002261538  hitchhiker  0.00376971  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_49  CDS  NC_011311  53193  54152  +  960  hypothetical protein  YP_002261539  normal  0.0169531  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_50  CDS  NC_011311  54700  55974  +  1275  hypothetical protein  YP_002261540  hitchhiker  0.00190835  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_51  CDS  NC_011311  56054  56626  +  573  hypothetical protein  YP_002261541  hitchhiker  0.00007961  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_52  CDS  NC_011311  57061  57801  -  741  transposase  YP_002261542  hitchhiker  0.00159101  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_53  CDS  NC_011311  58377  58655  -  279  putative plasmid stabilization system protein  YP_002261543  hitchhiker  0.000087371  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_54  CDS  NC_011311  58652  58936  -  285  hypothetical protein  YP_002261544  hitchhiker  0.000360582  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_55  CDS  NC_011311  59510  61699  +  2190  putative beta-N-acetylhexosaminidase precursor  YP_002261545  decreased coverage  0.000000313171  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_56  CDS  NC_011311  62129  64735  +  2607  hypothetical protein  YP_002261546  hitchhiker  0.0000490107  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_57  CDS  NC_011311  64735  67281  +  2547  hypothetical protein  YP_002261547  normal  0.0110641  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_58  CDS  NC_011311  67397  69208  -  1812  hypothetical protein  YP_002261548  decreased coverage  0.00445393  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_59  CDS  NC_011311  69201  70049  -  849  hypothetical protein  YP_002261549  normal  0.202791  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_60  CDS  NC_011311  70039  71070  -  1032  hypothetical protein  YP_002261550  normal  0.834031  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_61  CDS  NC_011311  71071  71682  -  612  hypothetical protein  YP_002261551  normal  0.469045  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_62  CDS  NC_011311  71703  72668  -  966  putative integrase  YP_002261552  normal  0.559018  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_63  CDS  NC_011311  72757  73302  -  546  hypothetical protein  YP_002261553  normal  0.294514  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_64  CDS  NC_011311  73303  74616  -  1314  calcineurin-like phosphoesterase  YP_002261554  normal  0.0515875  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_65  CDS  NC_011311  74928  76940  -  2013  hypothetical protein  YP_002261555  normal  0.0619487  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_66  CDS  NC_011311  77075  77350  -  276  DNA-binding protein HU-alpha  YP_002261556  normal  0.0113448  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_67  CDS  NC_011311  77364  77960  -  597  hypothetical protein  YP_002261557  normal  0.0260962  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_68  CDS  NC_011311  78757  79617  -  861  hypothetical protein  YP_002261558  normal  0.229504  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_69  CDS  NC_011311  80289  80525  +  237  hypothetical protein  YP_002261559  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_70  CDS  NC_011311  80554  81303  -  750  hypothetical protein  YP_002261560  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_71  CDS  NC_011311  81300  82244  -  945  membrane protein  YP_002261561  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p840_72  CDS  NC_011311  82244  83374  -  1131  membrane protein  YP_002261562  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>