26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_50 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  886    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  51.63 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  44.96 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  42.62 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  41.3 
 
 		 293 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  41.3 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  39.46 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  38.01 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  30.89 
 
 		 423 aa  169  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  24.48 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  24.2 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  24.04 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  23.72 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  42.17 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  23.45 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1095  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  38.36 
 
 		 485 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  27.82 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  22.18 
 
 		 309 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  21.86 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  22.51 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2454  hypothetical protein  21.16 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000139037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  23.41 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  24.36 
 
 		 293 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>