18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_57 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3921  hypothetical protein  43.15 
 
 
854 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_57  hypothetical protein  100 
 
 
848 aa  1766    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1671  hypothetical protein  24.3 
 
 
817 aa  107  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1681  hypothetical protein  25.3 
 
 
799 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  35.63 
 
 
331 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  29.29 
 
 
327 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  28.57 
 
 
327 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  28.57 
 
 
327 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  29.07 
 
 
326 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.07 
 
 
326 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  28.41 
 
 
332 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  32.32 
 
 
332 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  28.57 
 
 
331 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  29.41 
 
 
332 aa  45.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  28.57 
 
 
331 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  34.52 
 
 
332 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  28.57 
 
 
360 aa  45.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  29.76 
 
 
331 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>