76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0013 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  729    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  77.84 
 
 		 353 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  28.81 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  31.09 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.63 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  29.15 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  31.21 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  31.56 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  30.28 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  33.45 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.9 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  30.39 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  30.23 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  28.37 
 
 		 420 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  34.28 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  32.65 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.07 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  33.45 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  31.51 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  30 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.02 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.82 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.73 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  27.97 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.62 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  28.82 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  24.05 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  33.52 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  25.82 
 
 		 752 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  27.55 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  23.84 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  23.84 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  24.06 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  24.22 
 
 		 882 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  23.24 
 
 		 745 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  28.4 
 
 		 728 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  26.59 
 
 		 728 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  22.83 
 
 		 727 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  26.64 
 
 		 728 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  24.2 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  27.17 
 
 		 727 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.38 
 
 		 575 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  29.93 
 
 		 555 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  30.17 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  26.92 
 
 		 729 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  23.77 
 
 		 745 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  26.36 
 
 		 728 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  26.54 
 
 		 729 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  26.54 
 
 		 729 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  26.59 
 
 		 728 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  26.44 
 
 		 735 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  25.77 
 
 		 729 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  24.48 
 
 		 635 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  26.44 
 
 		 742 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  26.15 
 
 		 742 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  25.16 
 
 		 728 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.51 
 
 		 752 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  25.77 
 
 		 742 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  26.15 
 
 		 592 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.8 
 
 		 749 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  25.6 
 
 		 587 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  25.79 
 
 		 728 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  23.3 
 
 		 630 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.7 
 
 		 746 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  26.15 
 
 		 728 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  24.81 
 
 		 572 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  22.45 
 
 		 769 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  26.06 
 
 		 647 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  23.28 
 
 		 630 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  22.94 
 
 		 650 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  24.62 
 
 		 732 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  25.53 
 
 		 618 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  24.9 
 
 		 728 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  24.3 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  22.92 
 
 		 649 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>