44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0862 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  93.93 
 
 
379 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  93.14 
 
 
379 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  60.57 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  32.42 
 
 
405 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  32.98 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.95 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  31.23 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.84 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  31.69 
 
 
396 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.03 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  34.59 
 
 
389 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  30.52 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.95 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  29.07 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.73 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  30.52 
 
 
403 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  32.77 
 
 
403 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  34.13 
 
 
404 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  30.56 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.33 
 
 
420 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  30.39 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.58 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  22.87 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.02 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.77 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.15 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  27.89 
 
 
424 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  28.42 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  22.22 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  30.69 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  30 
 
 
882 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  31.58 
 
 
486 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  29.07 
 
 
566 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  30.21 
 
 
539 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.1 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  30.43 
 
 
533 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  28.82 
 
 
552 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  29.69 
 
 
524 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  33.77 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  30.33 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  29.46 
 
 
745 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  27.7 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  29.46 
 
 
745 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>