43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0911 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  98.68 
 
 
379 aa  684    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
379 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  93.93 
 
 
379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  61.36 
 
 
379 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  32.8 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.34 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.1 
 
 
400 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  31.3 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  30.41 
 
 
406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  34.59 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.49 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  30.72 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.88 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  31.38 
 
 
396 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.84 
 
 
403 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  28.27 
 
 
403 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
403 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  31.37 
 
 
403 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  34.57 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  31.39 
 
 
409 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  30.56 
 
 
420 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.7 
 
 
426 aa  86.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  28.95 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  23.55 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.27 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  28.97 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  27.55 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  31.38 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  28.28 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  23.42 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  28.69 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  30.66 
 
 
882 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  32.52 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  29.34 
 
 
539 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  30.14 
 
 
566 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  29.63 
 
 
524 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  29.79 
 
 
552 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  31.52 
 
 
533 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  29.79 
 
 
539 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  27.32 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  27.06 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.06 
 
 
745 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  31.02 
 
 
523 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>