41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2404 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  66.56 
 
 		 298 aa  417  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  60.2 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  60.2 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  39.39 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  40.89 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  36.98 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  36.86 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  27.36 
 
 		 487 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  25.47 
 
 		 487 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.39 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  25.86 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  26.24 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  23.7 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  25.25 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  30.86 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  31.43 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  24.47 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  33.6 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  29.7 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  28.43 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  21.62 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  23.83 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.27 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  24.48 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  23.63 
 
 		 403 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  24.48 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  30.41 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2951  hypothetical protein  25.5 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  24.27 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  19.93 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  34.72 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  21.43 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  25.31 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>