42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1363 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  788    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  96.34 
 
 
383 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  31.77 
 
 
622 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
622 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  22.8 
 
 
313 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  32.09 
 
 
267 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 
589 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  25.56 
 
 
311 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  28.96 
 
 
522 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.93 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  28.63 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.59 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  22.9 
 
 
311 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  22.85 
 
 
307 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  23.3 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  24.02 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.8 
 
 
611 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  26.12 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  25.75 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.49 
 
 
592 aa  83.6  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  23.6 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  25.37 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  22.5 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  28.63 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  24.11 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.9 
 
 
596 aa  72  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  25.29 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  25.68 
 
 
266 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.32 
 
 
590 aa  66.6  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.99 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  22.41 
 
 
244 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  27.18 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.4 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  20.94 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  19.32 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  20.19 
 
 
349 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  22.98 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  19.9 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  24.26 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  19.84 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  24.04 
 
 
255 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  21 
 
 
297 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>