More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0050 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  849    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  98.38 
 
 
431 aa  835    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  65.49 
 
 
441 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  65.02 
 
 
437 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 
427 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  37.23 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 
419 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 
418 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 
420 aa  172  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  34.51 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 
436 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  36.79 
 
 
423 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 
408 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.25 
 
 
489 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  32.18 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  32.18 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  30 
 
 
449 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  32.42 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  32.42 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  32.42 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  32.42 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  32.42 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  32.41 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  30.24 
 
 
467 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.74 
 
 
467 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  33.03 
 
 
471 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  33.03 
 
 
471 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.98 
 
 
467 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.98 
 
 
467 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 
495 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  30.24 
 
 
467 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 
471 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
495 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  33.26 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.52 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  33.03 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.52 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.52 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  29.52 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  35.98 
 
 
430 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
740 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  34.91 
 
 
438 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
475 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
486 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 
510 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 
716 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
494 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 
495 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  29 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 
408 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  30.21 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  31.72 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  36.48 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.51 
 
 
497 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  28.84 
 
 
542 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 
476 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  28.6 
 
 
543 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 
468 aa  136  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  29.51 
 
 
480 aa  136  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  36.3 
 
 
418 aa  136  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  30.89 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  31.12 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  30.66 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.22 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  30 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
518 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 
506 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
786 aa  134  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  28 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  29.52 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 
463 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  28.82 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  29.75 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 
478 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 
773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.64 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 
456 aa  128  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 
500 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
476 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.11 
 
 
525 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>