More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2081 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  99.11 
 
 
337 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  100 
 
 
337 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  99.7 
 
 
337 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 
344 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.2 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
369 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.22 
 
 
346 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.02 
 
 
312 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 
329 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  27.6 
 
 
342 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.37 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.39 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 
326 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.4 
 
 
332 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  29.36 
 
 
332 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
361 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
341 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
350 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  27.98 
 
 
337 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.57 
 
 
338 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
387 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.24 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
325 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
347 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
341 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
331 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
320 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
334 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
338 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.02 
 
 
310 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
344 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.73 
 
 
353 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25.85 
 
 
340 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 
377 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 
340 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.36 
 
 
347 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.2 
 
 
351 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.38 
 
 
335 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.2 
 
 
347 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.2 
 
 
351 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
351 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  30.09 
 
 
331 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.2 
 
 
351 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
351 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 
349 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.2 
 
 
351 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.2 
 
 
351 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
349 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.03 
 
 
332 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.59 
 
 
310 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
340 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
340 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.71 
 
 
319 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
360 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
359 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 
355 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
328 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
328 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 
329 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
347 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
377 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  27.88 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
360 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.69 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.26 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
337 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.01 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.92 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  26.69 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  41.3 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
359 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  30.97 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>