80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1154 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  265  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  99.3 
 
 		 142 aa  263  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  99.3 
 
 		 142 aa  263  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  81.69 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  80.99 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.58 
 
 		 142 aa  196  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.17 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.35 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  63.83 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  63.83 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  62.86 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  60.99 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  60.99 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  42.75 
 
 		 293 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.93 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  47.1 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  39.01 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  41.84 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  41.84 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.48 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  41.48 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 		 287 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  43.17 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.13 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  39.29 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  41.3 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  39.29 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.29 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  40.3 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  41.43 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.98 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.45 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.43 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  36.81 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  35.2 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  39.84 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  22.07 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.38 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.3 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  26.79 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  26.36 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 318 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  24.79 
 
 		 308 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.15 
 
 		 303 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  31.09 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  27.54 
 
 		 300 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  34.21 
 
 		 293 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>