71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0794 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  57.64 
 
 
647 aa  750    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  62.66 
 
 
647 aa  786    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  69.76 
 
 
637 aa  917    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  69.76 
 
 
637 aa  917    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1315    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  99.37 
 
 
636 aa  1306    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  29.68 
 
 
616 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  30.09 
 
 
633 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  30.14 
 
 
633 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  30.06 
 
 
621 aa  201  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  30.06 
 
 
621 aa  201  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  27.55 
 
 
639 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  25.91 
 
 
641 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  27.03 
 
 
634 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28 
 
 
632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  26.49 
 
 
634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  25.48 
 
 
635 aa  180  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  26.78 
 
 
638 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  26.61 
 
 
638 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  27.23 
 
 
588 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  27.29 
 
 
626 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  27.29 
 
 
632 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  26.48 
 
 
637 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  27.29 
 
 
626 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  27.29 
 
 
634 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  27.29 
 
 
629 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  27.29 
 
 
626 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  27.37 
 
 
647 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  27.37 
 
 
647 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  26.04 
 
 
665 aa  164  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  31.36 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
1096 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  24.44 
 
 
613 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  24.44 
 
 
613 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
1256 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
1256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  25.93 
 
 
1256 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  26.33 
 
 
753 aa  113  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
1253 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.43 
 
 
1225 aa  95.1  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  26.85 
 
 
1042 aa  91.3  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  33.71 
 
 
659 aa  90.5  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  25.07 
 
 
672 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.88 
 
 
1433 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  22.58 
 
 
672 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.42 
 
 
1433 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  28.02 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
1338 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.88 
 
 
1431 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.08 
 
 
664 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  21.71 
 
 
667 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  24.56 
 
 
673 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  20.35 
 
 
856 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  21.53 
 
 
1257 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  31.97 
 
 
1028 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.01 
 
 
632 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  24.44 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  21.92 
 
 
840 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  31.38 
 
 
658 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  22.68 
 
 
637 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  20.66 
 
 
635 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  28.08 
 
 
636 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  29.51 
 
 
684 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  25.56 
 
 
633 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  30.37 
 
 
624 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  29.84 
 
 
624 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  20.07 
 
 
898 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  35.9 
 
 
704 aa  47.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  24.35 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  25.58 
 
 
621 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3205  hypothetical protein  35.06 
 
 
414 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168746  normal  0.0109515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>