31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0861 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  100 
 
 		 409 aa  793    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  98.04 
 
 		 409 aa  780    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  52.93 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.8 
 
 		 413 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  29.07 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.65 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  29.44 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  29.44 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  29.52 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  23.53 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.55 
 
 		 773 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  21.22 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  24.22 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.79 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2737  O-antigen polymerase  35.09 
 
 		 542 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  24.23 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  23.16 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  22.87 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  32.14 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  32.14 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>