More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2249 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  55.51 
 
 
226 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 
232 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
225 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  51.18 
 
 
204 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
228 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.52 
 
 
210 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  34.48 
 
 
281 aa  132  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 
198 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  40.91 
 
 
232 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
207 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  41.51 
 
 
210 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 
208 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  42.31 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 
215 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 
207 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  42.03 
 
 
218 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  34.3 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 
232 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  41.3 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 
240 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 
234 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 
226 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 
226 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
223 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 
225 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 
214 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
249 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 
224 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 
220 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
212 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 
212 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.11 
 
 
214 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.04 
 
 
427 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
227 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 
202 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
209 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.59 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  38.29 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
221 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
221 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  39.75 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
210 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.26 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.76 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  38.03 
 
 
220 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
411 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.41 
 
 
365 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.41 
 
 
365 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.41 
 
 
365 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  41.76 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
378 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.76 
 
 
369 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
213 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
211 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  43.95 
 
 
383 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 
370 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.32 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  43.09 
 
 
440 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.62 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  36.62 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.62 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>