201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1194 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  67.98 
 
 
766 aa  989    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  53.55 
 
 
775 aa  801    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  51.09 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  50.49 
 
 
780 aa  735    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  56.6 
 
 
779 aa  818    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  52.89 
 
 
772 aa  823    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  52.76 
 
 
772 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  67.3 
 
 
681 aa  929    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  52.89 
 
 
772 aa  823    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  53.43 
 
 
772 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  51.88 
 
 
770 aa  801    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  66.49 
 
 
775 aa  985    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  61.82 
 
 
760 aa  937    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  53.3 
 
 
772 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
804 aa  1621    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  59.43 
 
 
775 aa  875    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  51.95 
 
 
764 aa  803    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  53.3 
 
 
772 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  53.56 
 
 
772 aa  827    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  47.61 
 
 
712 aa  679    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  52.49 
 
 
772 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  62.94 
 
 
749 aa  925    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  52.26 
 
 
823 aa  759    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  53.3 
 
 
772 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  52.09 
 
 
763 aa  803    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  53.57 
 
 
772 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  54.37 
 
 
772 aa  827    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  53.99 
 
 
764 aa  798    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  63.3 
 
 
763 aa  852    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  58.73 
 
 
771 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  52.62 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  52.76 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  52.76 
 
 
772 aa  823    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  62.48 
 
 
777 aa  900    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  57.24 
 
 
774 aa  897    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  52.39 
 
 
780 aa  783    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  65.33 
 
 
760 aa  959    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  45.95 
 
 
608 aa  565  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  40.56 
 
 
760 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  40.55 
 
 
765 aa  452  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  43.29 
 
 
765 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 
799 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  36.96 
 
 
757 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  36.31 
 
 
795 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  35.28 
 
 
794 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 
778 aa  325  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 
695 aa  324  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  32.2 
 
 
752 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
784 aa  297  5e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.41 
 
 
803 aa  274  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  30.5 
 
 
755 aa  273  1e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.94 
 
 
779 aa  271  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.15 
 
 
836 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.77 
 
 
770 aa  258  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.77 
 
 
768 aa  254  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.9 
 
 
828 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.11 
 
 
821 aa  250  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 
779 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.89 
 
 
801 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.79 
 
 
797 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.56 
 
 
792 aa  241  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  32.23 
 
 
779 aa  239  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.09 
 
 
776 aa  237  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  29.05 
 
 
799 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.28 
 
 
752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
743 aa  230  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.84 
 
 
794 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.88 
 
 
746 aa  230  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.28 
 
 
777 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  30.19 
 
 
803 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.14 
 
 
785 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.95 
 
 
806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.39 
 
 
788 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  30.16 
 
 
806 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.39 
 
 
806 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.95 
 
 
798 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  29.66 
 
 
803 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
806 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
806 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
813 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  29.85 
 
 
806 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.69 
 
 
803 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 
806 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.46 
 
 
700 aa  203  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.02 
 
 
815 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  29.4 
 
 
816 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28 
 
 
788 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.83 
 
 
791 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.26 
 
 
845 aa  197  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  30.04 
 
 
821 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  28.39 
 
 
668 aa  194  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  27.37 
 
 
656 aa  194  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.29 
 
 
828 aa  194  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.8 
 
 
788 aa  194  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  26.64 
 
 
661 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 
799 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.59 
 
 
825 aa  190  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.38 
 
 
821 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  28.02 
 
 
661 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.53 
 
 
783 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>