50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3470 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  544  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  50.47 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  44.4 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  43.4 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  45.85 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  44.3 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  45.54 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  43.24 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  43.46 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  43.44 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  37.18 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  44.4 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  42.79 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  39.63 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  35.04 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  41.53 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  41.73 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  40.08 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  40.08 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  37.28 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  39.1 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  41.05 
 
 		 249 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  41.88 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  41.13 
 
 		 253 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  37.25 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  33.75 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  37.83 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  40.51 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  35.34 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  37.1 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  37.84 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  36.52 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  39.32 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  39.79 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  38.59 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  28.02 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  31 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  30.48 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  35.68 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.5 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.36 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  39.83 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.93 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>