More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1581 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
563 aa  1050    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1038  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.3 
 
 
544 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0466413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.02 
 
 
565 aa  243  7e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2661  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.23 
 
 
556 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.6 
 
 
555 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0999  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.32 
 
 
574 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01540  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.95 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
748 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
500 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0811  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.51 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.65371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
669 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
669 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
662 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  30.25 
 
 
674 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 
1264 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.61 
 
 
674 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  31.89 
 
 
669 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  31 
 
 
667 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  35.08 
 
 
748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 
683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.82 
 
 
669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 
1253 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.02 
 
 
790 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  33.11 
 
 
687 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
577 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.79 
 
 
659 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  31.4 
 
 
671 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.77 
 
 
542 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  29.63 
 
 
673 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  30.99 
 
 
669 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  30.62 
 
 
637 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
662 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.43 
 
 
688 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 
479 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  29.73 
 
 
679 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  31.7 
 
 
646 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  32.75 
 
 
499 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
1265 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  33.56 
 
 
672 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.46 
 
 
659 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.05 
 
 
669 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  31.29 
 
 
668 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
666 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
498 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.93 
 
 
673 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  28.37 
 
 
674 aa  103  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
1265 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.56 
 
 
666 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  35.99 
 
 
666 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.86 
 
 
666 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.77 
 
 
698 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
672 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
665 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.67 
 
 
672 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.67 
 
 
672 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.67 
 
 
672 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
792 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  30.67 
 
 
672 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.95 
 
 
952 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.06 
 
 
969 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.76 
 
 
494 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
654 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.53 
 
 
532 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.26 
 
 
672 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  34.34 
 
 
660 aa  98.2  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  34.34 
 
 
660 aa  98.2  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  27.97 
 
 
644 aa  98.2  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.42 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  30.72 
 
 
1245 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 
665 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.1 
 
 
969 aa  97.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.23 
 
 
661 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.79 
 
 
800 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.55 
 
 
949 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  35.81 
 
 
663 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1702  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.7 
 
 
544 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0585222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  34.9 
 
 
681 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.29 
 
 
782 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  29.76 
 
 
737 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  30.28 
 
 
640 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.94 
 
 
799 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  27.54 
 
 
497 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  27.54 
 
 
497 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  26.52 
 
 
644 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  34.6 
 
 
497 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.14 
 
 
668 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.13 
 
 
772 aa  94  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.59 
 
 
500 aa  94  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  28.77 
 
 
486 aa  93.6  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  34.12 
 
 
672 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.76 
 
 
472 aa  93.6  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.86 
 
 
800 aa  93.6  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.86 
 
 
800 aa  93.6  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.8 
 
 
507 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1399  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  32.14 
 
 
437 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 
490 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.93 
 
 
505 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.41 
 
 
768 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.79 
 
 
770 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>