More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1131 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  55.97 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  53.23 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  53.23 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  53.23 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  53.23 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  53.23 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  52.9 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  52.9 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  52.7 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  53.38 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  53.04 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 295 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  53.58 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  50.34 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  51.56 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  48.99 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  48.99 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  48.99 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  50.52 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  48.65 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  48.65 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  48.31 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.61 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  48.31 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  49.13 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  34.36 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  34.36 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  34.02 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  34.02 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  34.02 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.65 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  42.65 
 
 		 296 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.29 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  38.4 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  38.11 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>