More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0977 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0977  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.324807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0007  translation initiation factor IF-3  54.91 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00109287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.25 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 190 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 238 aa  160  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 225 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 192 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  48.39 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  48.39 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  48.39 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  47.74 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 219 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  47.74 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 151 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.76 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 192 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 194 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  45.73 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 227 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0935  translation initiation factor IF-3  52.83 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00138169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 233 aa  147  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  42.77 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  45.96 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 252 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 239 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.75 
 
 		 243 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  52.24 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  52.24 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 233 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45.86 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  45.78 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  43.05 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.03 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2137  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194801  hitchhiker  0.00234339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  45.4 
 
 		 329 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 232 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 230 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 205 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  43.27 
 
 		 176 aa  140  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  53.03 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>