265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3508 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
342 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  52 
 
 
344 aa  338  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  41.06 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  39.61 
 
 
365 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  34.47 
 
 
335 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.99 
 
 
331 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 
331 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  34.5 
 
 
354 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
915 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  28.28 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  30.79 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 
365 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.08 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.82 
 
 
331 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.45 
 
 
1075 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
1004 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.51 
 
 
357 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.82 
 
 
323 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.71 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  27.05 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1004 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 
333 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  27.27 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.63 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.47 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.53 
 
 
593 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.09 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  29.1 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.17 
 
 
360 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  29.01 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  29.23 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.03 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.49 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.14 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.38 
 
 
1238 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  30.09 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  24.83 
 
 
674 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  25.42 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.57 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.42 
 
 
322 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.77 
 
 
332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
333 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.16 
 
 
332 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.75 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.78 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  28.7 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.55 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.55 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.52 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.52 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.9 
 
 
686 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.55 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.18 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  28.86 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.55 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  26.81 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.19 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  24.58 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.02 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.18 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  28.74 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.64 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.65 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.31 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  25.28 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  24.41 
 
 
322 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.83 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  26.47 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  25.94 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  22.27 
 
 
856 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.83 
 
 
821 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  24.26 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  27.31 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.64 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.39 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.27 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  26.27 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.73 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.14 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.27 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.25 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.17 
 
 
1065 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.19 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  26.16 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  26.16 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>