More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2130 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2130  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  67.2 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  59.68 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  49.68 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  49.84 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  50 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  50.32 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  50 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  50 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  45.39 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.3 
 
 		 306 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  46.6 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.59 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  44.12 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.75 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  46.28 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  47.08 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  49.68 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  46.75 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  44.85 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  46.51 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.75 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.63 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  49.15 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  47.21 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  48.88 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.03 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  48.17 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.61 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  44.98 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  48.56 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.46 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.47 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.81 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.94 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.59 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.42 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.97 
 
 		 310 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.68 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  45.39 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43.18 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.67 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.41 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  50.17 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  50.17 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  44.82 
 
 		 321 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.29 
 
 		 307 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.16 
 
 		 317 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  49.83 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  43.71 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  42.41 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.89 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.67 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.77 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.48 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.14 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  47.84 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  41.06 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.66 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  37.66 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.47 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.69 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.3 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  45.33 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  43.05 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.2 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.16 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.48 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  40.53 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.13 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  40.53 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  36.81 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  36.81 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  40.53 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  34.53 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  47.02 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.2 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.2 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.2 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.2 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.2 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  45.75 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  44.15 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.16 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  40.73 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  40.73 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  40.73 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  40.73 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.46 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  40.73 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.03 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  40.94 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  39.4 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>