More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5501 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
311 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  45.78 
 
 
172 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  50.62 
 
 
175 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  47.2 
 
 
169 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  46.79 
 
 
168 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  48.43 
 
 
322 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
175 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.03 
 
 
170 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  47.5 
 
 
166 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  47.2 
 
 
169 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  47.2 
 
 
169 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  47.2 
 
 
169 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  45.57 
 
 
174 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  49.07 
 
 
175 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  46.58 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  45.75 
 
 
180 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  46.58 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  46.58 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  44.13 
 
 
311 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  43.95 
 
 
174 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  44.17 
 
 
180 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  45.51 
 
 
183 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  44.94 
 
 
156 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  47.71 
 
 
171 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
169 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  48.75 
 
 
175 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 
188 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.08 
 
 
166 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.95 
 
 
165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  43.48 
 
 
172 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  42.04 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.72 
 
 
190 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  44.79 
 
 
174 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  44.79 
 
 
169 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
188 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
188 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
193 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 
188 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.69 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.04 
 
 
171 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.19 
 
 
311 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
182 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42 
 
 
190 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  44.08 
 
 
172 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.87 
 
 
172 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.56 
 
 
169 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
175 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.29 
 
 
186 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  46.15 
 
 
172 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 
172 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.22 
 
 
188 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  44.31 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  47.01 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
170 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  47.01 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  43.12 
 
 
169 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 
170 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.7 
 
 
311 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
175 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.65 
 
 
169 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  42.29 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
393 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
186 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  40.65 
 
 
187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 
183 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 
170 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
167 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.39 
 
 
207 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  46.27 
 
 
226 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
191 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
191 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.21 
 
 
179 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 
160 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  44.52 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  39.1 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.32 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  44.17 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.32 
 
 
192 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 
184 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.29 
 
 
186 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.94 
 
 
177 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  41.29 
 
 
164 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
173 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>