More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5250 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  100 
 
 		 390 aa  792    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  76.81 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  74.35 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  70 
 
 		 349 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  66.09 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  66.18 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  66.09 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  54.94 
 
 		 338 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  58.48 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  54.68 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  51.31 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  48.58 
 
 		 352 aa  332  8e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.66 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  49.85 
 
 		 335 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  40.23 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  39.2 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  40.32 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  38.4 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  38.25 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  38 
 
 		 295 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  38 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  38 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  38 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  36.26 
 
 		 282 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  36.65 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  38.4 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  36 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  37.98 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  38.19 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  36.9 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  36.8 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  34.23 
 
 		 284 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.31 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  35.97 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  37.5 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  36.65 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  35.29 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  37.7 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  36.68 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  33.46 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.3 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  38.61 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  38.34 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  38.61 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  35.74 
 
 		 286 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  37.84 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  36.55 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  35.57 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  37.88 
 
 		 307 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.58 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  36.47 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  36.08 
 
 		 288 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  36.72 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  38.35 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  36.72 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  34.9 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  34.9 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  34.9 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  34.9 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  36.72 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  37.69 
 
 		 303 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  34.9 
 
 		 286 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  34.26 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  36.33 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  36.33 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  36 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  35.74 
 
 		 290 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  35.8 
 
 		 294 aa  136  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 286 aa  136  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.89 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  34.88 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  35.69 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  36.36 
 
 		 302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  33.99 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  35.34 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  35.69 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  36.09 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  36.82 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.94 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  34.77 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  33.85 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  34.54 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.18 
 
 		 304 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  38.52 
 
 		 298 aa  133  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  37.35 
 
 		 285 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  34.63 
 
 		 288 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  36.58 
 
 		 288 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  36.9 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  35.09 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>