More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3908 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 423 aa  838    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  59.62 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  56.35 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  56.42 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  56.1 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  56.69 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  52.62 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  54.42 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  51.55 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  51.72 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  54.79 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  51.22 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  53.28 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  53.28 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  57.78 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  52.07 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  53.11 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  53.11 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  51.83 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  54.05 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  49.88 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  50.5 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  48.9 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  48.66 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  47.73 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  50.5 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  50.5 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  45.97 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  45.97 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  45.75 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  47.93 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  45.72 
 
 		 430 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  48.06 
 
 		 487 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  48.3 
 
 		 484 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  46.1 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  41.9 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  43.96 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  48.74 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  48.91 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  46.07 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  44.71 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  40 
 
 		 420 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  37.95 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  40.92 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.35 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.18 
 
 		 432 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.4 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  34.68 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  33.33 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  31.64 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.76 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.38 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  31.49 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.9 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  26.63 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  27.61 
 
 		 544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  27.86 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  27.02 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.36 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  26.95 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  26.07 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  28.83 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  26.2 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  28.82 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  25.2 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.12 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  28.35 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.91 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.49 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.61 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  26.05 
 
 		 542 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  30.52 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  30.52 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  30.52 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  30.52 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  30.52 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.8 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.29 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.09 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  25.89 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  26.98 
 
 		 442 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  23.72 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  26.61 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  26.61 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  27.67 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 		 416 aa  92.8  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.92 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  32.56 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  31 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  32.56 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  32.56 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  31.89 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  26 
 
 		 547 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 		 547 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 		 547 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 		 547 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>