57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1077 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 333 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  58.25 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  54.81 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  50.99 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  50.63 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  47.68 
 
 		 325 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  49.84 
 
 		 315 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  51.74 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  49.83 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  46.77 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  44.88 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  35.8 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  35.8 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  34.23 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  35.8 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  34.23 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  34.23 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  34.46 
 
 		 373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  34.46 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  34.55 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  34.77 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  34.2 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  34.24 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  33.94 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  32.49 
 
 		 577 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  32.86 
 
 		 431 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  32.87 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  34.21 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  30.53 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  27.1 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  34.33 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  27.71 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  27.15 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  27.47 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  25.38 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  24.2 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.74 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  25.94 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  23.98 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  25.57 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  29.62 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.08 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  22.74 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  23.62 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  22.13 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  26.3 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  24.86 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  22.98 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  22.58 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>