More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3024 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  100 
 
 
292 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 
281 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.28 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
310 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.65 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  28.34 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  28.34 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
1301 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  30.45 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  27.94 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  28.46 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  25.7 
 
 
708 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
812 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
1250 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  35.19 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
1035 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 
957 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.61 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
672 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27.78 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.57 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.29 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
372 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  32.35 
 
 
102 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
613 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  28.71 
 
 
561 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.73 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.43 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
773 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.21 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.91 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>