50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05312 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  84.39 
 
 		 205 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  61.08 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  47.29 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  94.7  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  33.33 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  30.77 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  28.02 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  28.25 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  29.72 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  28.71 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  27.01 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  29.33 
 
 		 393 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  26.29 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  26.64 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.7 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  27.06 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  27.31 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  28.17 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  26.89 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  25.59 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  26.64 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  26.89 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  24.3 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  24.88 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  23.94 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.57 
 
 		 334 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.77 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  23.15 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  21.24 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  22.69 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  23.66 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.57 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  20.97 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  26.92 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  25.38 
 
 		 338 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  24.02 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.25 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.57 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  23.41 
 
 		 276 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  28.97 
 
 		 304 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  28.97 
 
 		 302 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  33.33 
 
 		 309 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  32.61 
 
 		 589 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>