264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000866 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  100 
 
 		 316 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  96.52 
 
 		 337 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  77.46 
 
 		 312 aa  507  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  77.56 
 
 		 315 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  51.04 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  53.19 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  49 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  51.53 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  49.48 
 
 		 323 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.53 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  47.1 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  48.2 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.67 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  44.64 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  44.17 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.33 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  36.81 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  38.25 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  36.29 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.96 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.01 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  31.72 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.84 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.3 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  27.62 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.98 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.98 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.97 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  23.86 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  23.43 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  24.43 
 
 		 587 aa  90.9  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.07 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  26.42 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  24 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.87 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  27.46 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  24.58 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  26.43 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.44 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.43 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  25.19 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.91 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  23.86 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.34 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.81 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.39 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  26.79 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.78 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  23.42 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.78 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  26.39 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.22 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.65 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  24.17 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.79 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.55 
 
 		 1075 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  31.21 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  33.07 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27.54 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.53 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  30.43 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  28.57 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.93 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  26.59 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.34 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.43 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.8 
 
 		 686 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  24.81 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  23.11 
 
 		 794 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  23.01 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.85 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>