More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0737 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  86.97 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  86.97 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  83.9 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  76.62 
 
 		 412 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  74.04 
 
 		 416 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  74.04 
 
 		 416 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  75.98 
 
 		 409 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  73.62 
 
 		 416 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  73.62 
 
 		 416 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  75.98 
 
 		 409 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  76.55 
 
 		 409 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  74.03 
 
 		 416 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  70.69 
 
 		 420 aa  338  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  77.09 
 
 		 408 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  71.11 
 
 		 408 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  71.37 
 
 		 408 aa  314  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  43.39 
 
 		 439 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  42.98 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  41.31 
 
 		 437 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  41.31 
 
 		 437 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  42.98 
 
 		 437 aa  187  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  43.78 
 
 		 436 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  42.15 
 
 		 440 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  42.56 
 
 		 437 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  42.15 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  42.15 
 
 		 440 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  42.15 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  44.74 
 
 		 434 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  42.29 
 
 		 442 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.56 
 
 		 437 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  46.08 
 
 		 433 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  44.3 
 
 		 434 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  44.24 
 
 		 449 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.2 
 
 		 436 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  45.16 
 
 		 434 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  40.5 
 
 		 438 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  43.42 
 
 		 445 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  44.21 
 
 		 410 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  40.34 
 
 		 435 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  40.34 
 
 		 440 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  41.74 
 
 		 441 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.34 
 
 		 440 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  40.55 
 
 		 447 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  41.67 
 
 		 424 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  38.79 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  41.48 
 
 		 409 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  38.79 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 409 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  41 
 
 		 443 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 433 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  41.55 
 
 		 457 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  41.78 
 
 		 449 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  39.65 
 
 		 436 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 444 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 444 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.78 
 
 		 444 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  41.7 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  41.15 
 
 		 437 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  40.98 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 440 aa  165  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  41.86 
 
 		 430 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  39.17 
 
 		 452 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  40.18 
 
 		 457 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  41.07 
 
 		 425 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  42.51 
 
 		 409 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  38.66 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  38.14 
 
 		 481 aa  154  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  39.66 
 
 		 402 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.13 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  39.48 
 
 		 425 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  40.72 
 
 		 427 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  38.64 
 
 		 444 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.41 
 
 		 435 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  39.57 
 
 		 435 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.1 
 
 		 445 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  34.84 
 
 		 425 aa  148  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 		 413 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 417 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  36.84 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  38.14 
 
 		 423 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 424 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 		 423 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 425 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37.83 
 
 		 423 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  37.83 
 
 		 423 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  37.83 
 
 		 423 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37.87 
 
 		 438 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  35.87 
 
 		 479 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>