224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0215 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0215  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  790    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.613438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001090  fOG: TPR repeat protein SEL1 subfamily  53.18 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04829  hypothetical protein  53.42 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0028  hypothetical protein  41.92 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1095  hypothetical protein  41.92 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.68 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1032 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 976 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.14 
 
 		 1200 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.36 
 
 		 789 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.5 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  29.07 
 
 		 1200 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.7 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.24 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1877 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.59 
 
 		 961 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.43 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1402 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.14 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  23.86 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1493 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  30.47 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  26.55 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1059 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.67 
 
 		 2413 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1110 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.53 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.6 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  25.89 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.08 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  25.22 
 
 		 831 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  23.95 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  24.89 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  22.7 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  29.69 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  25.29 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.51 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  25.62 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  29.69 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.5 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  23.01 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.71 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  29.69 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  31.54 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  31.25 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  22.77 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  27.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1430 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.36 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1002 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.69 
 
 		 234 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  28.91 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.43 
 
 		 865 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  28.79 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  24.28 
 
 		 765 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.79 
 
 		 685 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  27.71 
 
 		 1086 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.61 
 
 		 593 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.37 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  31.72 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.02 
 
 		 1261 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1160 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.43 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 1196 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  28.46 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.83 
 
 		 693 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 1012 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1366 aa  53.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  22.29 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.79 
 
 		 523 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.66 
 
 		 245 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  29.91 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  26.22 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  29.11 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 664 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 591 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>