More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1135 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  43 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.01 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 246 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.23 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.23 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.36 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  38.46 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 243 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.36 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.44 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  37.56 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.11 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  39.01 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  40.09 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.86 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  39.11 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  36.73 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.11 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.81 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  35.81 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  35.81 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  35.81 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>