More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0721 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  64.6 
 
 		 262 aa  301  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  65.92 
 
 		 260 aa  297  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  65.71 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  62.1 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  55.36 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  57.55 
 
 		 229 aa  254  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  57.08 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  56.81 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  56.81 
 
 		 221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  53.6 
 
 		 278 aa  243  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  52.7 
 
 		 278 aa  238  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  53.07 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  52.47 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  53.37 
 
 		 210 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  52.86 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 221 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  51.92 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  52.04 
 
 		 252 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  51.92 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  54.85 
 
 		 268 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 325 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  51.8 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 315 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  49.55 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 395 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 341 aa  228  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  51.92 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  50 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 222 aa  228  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  50 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 275 aa  225  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  53.59 
 
 		 286 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  52.47 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  54.07 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  51.87 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  48.61 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  48.86 
 
 		 275 aa  224  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 288 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 292 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 288 aa  224  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  51.11 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1255  30S ribosomal protein S3  50.66 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.378037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  50 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  48.42 
 
 		 302 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  51.92 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  53.62 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>