More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0725 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 441 aa  887    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  97.73 
 
 		 441 aa  873    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  48.51 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  41.31 
 
 		 457 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  42.51 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  44.53 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.06 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.82 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  43.2 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.35 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.59 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 465 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.35 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  44.23 
 
 		 451 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  42.82 
 
 		 484 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  41.24 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.33 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  42.31 
 
 		 453 aa  338  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  43.93 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.53 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 		 453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  44.63 
 
 		 464 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.81 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.81 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  40.18 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  40.5 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  43.37 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  44.87 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  42.34 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  42.14 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  40.38 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 451 aa  332  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.11 
 
 		 462 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 462 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  39.56 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  37.93 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  40.09 
 
 		 514 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  40.09 
 
 		 514 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 448 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  40.94 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 467 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  40.49 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  41.06 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  40.17 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  38.21 
 
 		 507 aa  328  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 		 451 aa  328  9e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  41.9 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  41.77 
 
 		 466 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  40.27 
 
 		 460 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 457 aa  325  9e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  40.77 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  41.4 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  41.05 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  39.1 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  42.45 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  42.01 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  39.57 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  39.12 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  39.76 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  38.18 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  40.81 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  38.76 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.51 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  39.76 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  40.09 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  42.47 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  41.5 
 
 		 457 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  38.32 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  41.35 
 
 		 466 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  39.22 
 
 		 478 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  40.86 
 
 		 456 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  40.86 
 
 		 456 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  40.86 
 
 		 456 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  38.18 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>