164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0881 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 374 aa  769    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  54.84 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  55.01 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  54.99 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  55.06 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  41.91 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  38.41 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 305 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  39.08 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  35.66 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  37.91 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 		 298 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  39.46 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  32.55 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  33.22 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  34.58 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  34.33 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  37.65 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 323 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.87 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  32.58 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  35.66 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 295 aa  110  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  24.91 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  20.93 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  23.51 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  21.5 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.45 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.64 
 
 		 243 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  28.38 
 
 		 303 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.11 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.48 
 
 		 243 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>